Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
DffaO54786 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
DffaO54786 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
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DffaO54786 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ppp4r3b-201ENSMUST00000020755 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
DffaO54786 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DffaO54786 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
DffaO54786 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
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