Protein–RNA interactions for Protein: O54751

Crx, Cone-rod homeobox protein, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxO54751 Vit-201ENSMUST00000024880 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Sidt1-201ENSMUST00000047446 4279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Srrt-209ENSMUST00000197466 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Triobp-204ENSMUST00000109690 7023 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
CrxO54751 Sowahb-201ENSMUST00000061328 3900 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 St6galnac5-201ENSMUST00000044278 5667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Myh6-201ENSMUST00000081857 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 4930534D22Rik-201ENSMUST00000181438 2715 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Necab1-202ENSMUST00000108273 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Lrp2-203ENSMUST00000100051 4359 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cep350-204ENSMUST00000138762 13307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 B4galt1-201ENSMUST00000030121 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Cbl-211ENSMUST00000206720 11372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Gm38187-201ENSMUST00000195609 4709 ntBASIC9.9□□□□□ -0.82
CrxO54751 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.9□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms