Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Sp100O35892 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Lrrc8e-201ENSMUST00000053035 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Nup205-201ENSMUST00000043815 6412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Sp100O35892 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Atxn7l3b-201ENSMUST00000099276 3566 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
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Sp100O35892 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
Sp100O35892 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Oas1e-201ENSMUST00000100785 1801 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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Sp100O35892 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Sp100O35892 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
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