Protein–RNA interactions for Protein: O35544

Slc1a6, Excitatory amino acid transporter 4, mousemouse

Predictions only

Length 561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a6O35544 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Fam13b-201ENSMUST00000040506 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Def8-203ENSMUST00000093049 1909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Zfp595-205ENSMUST00000171466 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Neu2-204ENSMUST00000165109 1824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 9130011E15Rik-201ENSMUST00000045396 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gad1-205ENSMUST00000130998 1705 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Dhrs4-201ENSMUST00000022821 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Cd80-201ENSMUST00000099816 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Slc1a6O35544 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms