Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Zyg11a-203ENSMUST00000223127 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ankrd13c-201ENSMUST00000040787 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Sarm1-201ENSMUST00000061174 4083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Frzb-201ENSMUST00000028389 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm15321-201ENSMUST00000121290 288 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ssh3-202ENSMUST00000113852 2735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 Ssh3-201ENSMUST00000037992 2728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Atf6bO35451 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms