Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Phldb1-218ENSMUST00000156918 3485 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Nif3l1-206ENSMUST00000171597 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Slc18a3O35304 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Olfr533-204ENSMUST00000216258 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm27194-201ENSMUST00000175753 2936 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Mpp3-202ENSMUST00000100400 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Slc18a3O35304 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms