Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Noxa1-202ENSMUST00000114373 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Chaf1a-201ENSMUST00000002914 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Iqcm-203ENSMUST00000212704 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 B930092H01Rik-201ENSMUST00000213377 2678 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Cdkn2aip-201ENSMUST00000038738 3464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.73
Ebi3O35228 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm9946-202ENSMUST00000162741 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Rit2-202ENSMUST00000139924 1674 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Wwox-201ENSMUST00000004756 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.46□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Prkcd-203ENSMUST00000112203 1927 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Pde7b-202ENSMUST00000164195 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Ebi3O35228 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
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