Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

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Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm13883-202ENSMUST00000151310 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Wnt7a-201ENSMUST00000032180 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ArxO35085 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Slc6a13-201ENSMUST00000064580 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ArxO35085 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Asb1-205ENSMUST00000188081 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Asb1-206ENSMUST00000188879 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ArxO35085 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms