Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Length 405 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Fgfr3-215ENSMUST00000202138 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Map1lc3b-201ENSMUST00000034270 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Ywhab-201ENSMUST00000018470 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Casq1O09165 Net1-201ENSMUST00000091853 2680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Hp1bp3-201ENSMUST00000030541 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Prrt3-205ENSMUST00000205170 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Creb3l3-201ENSMUST00000117422 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gpnmb-203ENSMUST00000204260 2430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Celsr1-201ENSMUST00000016172 10879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Map4k2-201ENSMUST00000025897 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Sumf2-204ENSMUST00000171300 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Lrrc29-201ENSMUST00000070508 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Kifc1-204ENSMUST00000173492 2350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Trpv4-202ENSMUST00000112217 2436 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Casq1O09165 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms