Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Oas1d-201ENSMUST00000044224 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Fgfr1op-201ENSMUST00000024636 3077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tnfrsf9-205ENSMUST00000116257 2115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gatad2a-201ENSMUST00000065169 3812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zfp536-201ENSMUST00000056338 4621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Zmynd15-201ENSMUST00000039093 2804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Htr1d-203ENSMUST00000121571 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Ces4a-201ENSMUST00000161289 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Smad2-201ENSMUST00000025453 2410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm6092-201ENSMUST00000121659 2029 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Pcdhb10-201ENSMUST00000051126 2851 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm3052-202ENSMUST00000188254 2224 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Fam71e2-202ENSMUST00000174409 2716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Snx31-203ENSMUST00000161202 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Olfr1113-202ENSMUST00000215611 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm10417-201ENSMUST00000194341 3522 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Aoc2-201ENSMUST00000041095 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Gm44271-201ENSMUST00000204525 2600 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Flcn-202ENSMUST00000091246 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Bub3-203ENSMUST00000207442 3414 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
PrkcshO08795 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Actn1-201ENSMUST00000021554 3734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Cdc42ep4-201ENSMUST00000053536 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Grpel2-201ENSMUST00000062991 4030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Sema6d-207ENSMUST00000103240 4372 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm43727-201ENSMUST00000198021 2647 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Cldn15-202ENSMUST00000111093 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm19165-201ENSMUST00000204453 1982 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Pla2g2f-201ENSMUST00000030526 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Tgfb1i1-201ENSMUST00000070656 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Ndc80-201ENSMUST00000024851 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Mlh1-201ENSMUST00000035079 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
PrkcshO08795 Itgb4-203ENSMUST00000106458 5779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms