Protein–RNA interactions for Protein: O08759

Ube3a, Ubiquitin-protein ligase E3A, mousemouse

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Length 870 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3aO08759 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Cluh-201ENSMUST00000092915 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Ube3aO08759 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ciz1-203ENSMUST00000113332 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm10433-202ENSMUST00000146364 1984 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Ube3aO08759 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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