Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Nudt21-201ENSMUST00000034204 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Stxbp1-202ENSMUST00000077458 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rgp1-202ENSMUST00000107886 5888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Cdc14a-202ENSMUST00000106491 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Sp9-201ENSMUST00000090813 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Sec22bO08547 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.3 ms