Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ldha-ps-201ENSMUST00000119390 995 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Atp1a2-201ENSMUST00000085913 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
MsmbO08540 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
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