Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Gm379J3QQ19 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Aifm2-203ENSMUST00000099706 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm28323-201ENSMUST00000186817 2499 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Treh-202ENSMUST00000071219 1927 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Cd33-201ENSMUST00000004728 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 AC137842.1-201ENSMUST00000227896 2064 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 AC122314.1-201ENSMUST00000223056 2239 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gsn-201ENSMUST00000028239 2653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Fosb-205ENSMUST00000208326 3654 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ctbs-201ENSMUST00000029840 2629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Cyth4-201ENSMUST00000043069 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tmem132a-202ENSMUST00000120524 3895 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Slc16a12-201ENSMUST00000009522 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Eogt-201ENSMUST00000054344 4424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Sema4a-215ENSMUST00000169222 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gcdh-202ENSMUST00000109745 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Fam187a-201ENSMUST00000100369 1563 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Lamc3-201ENSMUST00000028187 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Tmem136-201ENSMUST00000061833 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pak1-201ENSMUST00000033040 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Sh3bp5l-202ENSMUST00000116376 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Grin1-205ENSMUST00000114312 3838 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Grin1-207ENSMUST00000114317 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Gm379J3QQ19 Zfp207-201ENSMUST00000017567 2245 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms