Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Gm37187-201ENSMUST00000193425 341 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Cd40lg-201ENSMUST00000033466 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Clec4b1-201ENSMUST00000077228 674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Cib3-201ENSMUST00000098630 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Olfr1307-202ENSMUST00000099606 939 ntAPPRIS P1 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 AC158633.2-201ENSMUST00000222959 6046 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Npy1r-202ENSMUST00000212588 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Aldh4a1-201ENSMUST00000039818 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Slc6a18-201ENSMUST00000022105 2839 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm4865-201ENSMUST00000196284 1309 ntBASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Cntn4-203ENSMUST00000113258 2464 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.21□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ovch2-201ENSMUST00000106755 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Zfp59-201ENSMUST00000108331 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Olfr1254-203ENSMUST00000216587 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm28112-201ENSMUST00000190898 1875 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Myo6-204ENSMUST00000113268 7927 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Slc6a20a-201ENSMUST00000040960 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 4933439C10Rik-203ENSMUST00000132226 3184 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm10486-201ENSMUST00000101647 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm14632-201ENSMUST00000101654 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm15040-201ENSMUST00000118561 1241 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps99-201ENSMUST00000120067 766 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm14984-201ENSMUST00000120343 1263 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm12096-201ENSMUST00000121149 829 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 B430319H21Rik-201ENSMUST00000123420 734 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm23229-201ENSMUST00000157297 105 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Gm21887J3QQ04 Gm23773-201ENSMUST00000158985 296 ntBASIC7.2□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms