Protein–RNA interactions for Protein: J3QPZ4

Gm20877, MCG1032490, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20877J3QPZ4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Slc35d1-203ENSMUST00000150285 4242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Cep68-201ENSMUST00000050611 4804 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ube3a-216ENSMUST00000202945 3889 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Minos1-203ENSMUST00000143971 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm20877J3QPZ4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Lingo1-202ENSMUST00000114247 2287 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Usp33-209ENSMUST00000197748 4183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 A530013C23Rik-201ENSMUST00000130679 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Ddx27-205ENSMUST00000150571 2151 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Phactr3-205ENSMUST00000108917 4858 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm20877J3QPZ4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60 ms