Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pus7-201ENSMUST00000119946 3407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mark2-215ENSMUST00000168872 2124 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hhatl-202ENSMUST00000163981 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rpsa-201ENSMUST00000035105 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Polr2c-202ENSMUST00000211939 3881 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Glis2-201ENSMUST00000014447 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tex10-201ENSMUST00000030030 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mks1-201ENSMUST00000038196 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pnpla6-211ENSMUST00000207941 4263 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Gm8356J3QPD3 Gm45242-201ENSMUST00000210666 2129 ntBASIC11.74□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms