Protein–RNA interactions for Protein: J3QP87

Gm2035, Predicted pseudogene 2035, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2035J3QP87 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Cfap157-201ENSMUST00000102813 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rnd1-202ENSMUST00000109149 1034 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 2610528J11Rik-201ENSMUST00000030261 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Dhx37-201ENSMUST00000169485 4760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Noct-201ENSMUST00000023849 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Gm2035J3QP87 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms