Protein–RNA interactions for Protein: J3QP38

Gm21900, Predicted gene, 21900, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21900J3QP38 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Fbln1-201ENSMUST00000057410 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Olfr1411-203ENSMUST00000216444 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Cox10-201ENSMUST00000049091 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Nfkb2-201ENSMUST00000073116 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pcdhga9-201ENSMUST00000091935 4724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Scg3-202ENSMUST00000213324 2152 ntTSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ccdc85a-202ENSMUST00000093253 5431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pitpnm3-201ENSMUST00000075258 6555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Emx2os-201ENSMUST00000136990 5023 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Banp-201ENSMUST00000026354 1970 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hacd2-201ENSMUST00000061156 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Shroom1-201ENSMUST00000018531 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Polr3g-201ENSMUST00000048993 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tmem206-201ENSMUST00000027940 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 2410002F23Rik-206ENSMUST00000107950 3336 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Tmem39a-201ENSMUST00000002924 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Ccdc162-208ENSMUST00000179614 2739 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Rnf19b-202ENSMUST00000097874 1992 ntTSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
Gm21900J3QP38 Bysl-201ENSMUST00000024783 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
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