Protein–RNA interactions for Protein: J3QP01

Gm5108, Predicted gene 5108, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5108J3QP01 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Cgnl1-202ENSMUST00000121322 6541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Lrig2-201ENSMUST00000046316 7099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Phf21b-201ENSMUST00000016768 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Zbtb7b-201ENSMUST00000029677 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Elk1-201ENSMUST00000009550 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Tmem132e-202ENSMUST00000092852 4105 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm5108J3QP01 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm5108J3QP01 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Tnks1bp1-201ENSMUST00000048400 4799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm5108J3QP01 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Pold3-201ENSMUST00000032969 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm5108J3QP01 Chd7-201ENSMUST00000039267 9444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm5108J3QP01 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gpa33-202ENSMUST00000060833 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Rtn4-203ENSMUST00000102841 4060 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Camsap3-202ENSMUST00000171962 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Gm5108J3QP01 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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