Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Acer1-201ENSMUST00000056113 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Plet1-201ENSMUST00000114474 1689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Vps36-201ENSMUST00000033866 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Set-202ENSMUST00000102866 2824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tmc4-201ENSMUST00000038743 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tnk2-205ENSMUST00000115124 4424 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Mgmt-201ENSMUST00000081510 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Daxx-207ENSMUST00000174146 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Dnaic2-202ENSMUST00000092469 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gcdh-201ENSMUST00000003907 2167 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Fam161a-203ENSMUST00000109557 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Lats2-207ENSMUST00000173990 3834 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Sorcs1-201ENSMUST00000072685 4396 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Tfr2-204ENSMUST00000196471 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Zap70-201ENSMUST00000027291 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Smim18J3QNP2 Bcl11a-201ENSMUST00000000881 3061 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65 ms