Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Rpl13-ps1-201ENSMUST00000121801 668 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm15966-201ENSMUST00000136853 480 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Mecr-201ENSMUST00000030742 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Eif3i-201ENSMUST00000102593 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm38411-201ENSMUST00000197971 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm14019-201ENSMUST00000131514 403 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm7008-202ENSMUST00000170019 402 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ccdc180J3QNE4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm9445-201ENSMUST00000207454 1285 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm45186-201ENSMUST00000206874 478 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Fhl4-202ENSMUST00000216889 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Mospd4-201ENSMUST00000180618 576 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Cops4-201ENSMUST00000045993 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm38297-201ENSMUST00000195122 1057 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc180J3QNE4 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms