Protein–RNA interactions for Protein: J3QN17

Gm20918, Predicted gene, 20918, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20918J3QN17 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Fzd1-201ENSMUST00000054294 4197 ntAPPRIS P1 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Grin1-202ENSMUST00000114307 4127 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ddi2-202ENSMUST00000177592 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Setdb1-203ENSMUST00000107171 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cpeb3-204ENSMUST00000126188 4224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Gm20918J3QN17 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms