Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Rsbn1l-202ENSMUST00000196780 7651 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cplx4-201ENSMUST00000025397 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Engase-202ENSMUST00000135383 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gbf1-201ENSMUST00000026254 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cldn34c1-201ENSMUST00000113343 3301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Fbn1-202ENSMUST00000103234 11971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
Cldn34c3J3QJW5 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.97□□□□□ -0.65
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