Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Gm21818J3KMS6 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm21818J3KMS6 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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