Protein–RNA interactions for Protein: G5E8I7

Usp17lc, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein C, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17lcG5E8I7 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp17lcG5E8I7 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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Usp17lcG5E8I7 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Usp17lcG5E8I7 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Gm2694-202ENSMUST00000180806 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp17lcG5E8I7 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Usp17lcG5E8I7 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Usp17lcG5E8I7 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp17lcG5E8I7 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Usp17lcG5E8I7 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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