Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 Arid5a-203ENSMUST00000115031 3002 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fam160a2-201ENSMUST00000048079 3443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rnf214-201ENSMUST00000058720 3964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hsd3b7-201ENSMUST00000046863 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Aff4-201ENSMUST00000060945 10099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Tspan12-201ENSMUST00000031678 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Trim27-205ENSMUST00000221464 1400 ntTSL 5 BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.11□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 BC048403-202ENSMUST00000136432 2968 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
Vmn1r58G3X9U3 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms