Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf148G3X9R7 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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Rnf148G3X9R7 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Krt35-201ENSMUST00000103127 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Rnf148G3X9R7 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf148G3X9R7 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf148G3X9R7 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf148G3X9R7 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Rnf148G3X9R7 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Rnf148G3X9R7 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
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