Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.79□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm10434-201ENSMUST00000101158 471 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Fgf8-204ENSMUST00000111925 702 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rfc4-202ENSMUST00000115337 416 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm4760-201ENSMUST00000119663 1030 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gpihbp1-203ENSMUST00000189874 1652 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Zfp637-210ENSMUST00000164472 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm20416-201ENSMUST00000174760 484 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Anapc16-203ENSMUST00000182152 847 ntTSL 2 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm21411-201ENSMUST00000049821 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Etfrf1-203ENSMUST00000111721 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.78□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Selenoh-203ENSMUST00000117299 747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Gm648-201ENSMUST00000081133 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cdc26-201ENSMUST00000084525 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.68
Usp9yF8VPU6 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm10040-201ENSMUST00000080726 1662 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Cd300ld2-202ENSMUST00000106578 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm36264-202ENSMUST00000221989 1142 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Lcn6-201ENSMUST00000059693 1254 ntTSL 5 BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
Usp9yF8VPU6 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.69
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