Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Abhd11os-203ENSMUST00000222613 363 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm18916-201ENSMUST00000198264 1246 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Syngap1F6SEU4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms