Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

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Length 1,021 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mrgprh-201ENSMUST00000075296 1809 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Rprd1b-202ENSMUST00000103123 4504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Ccl25-201ENSMUST00000024004 1058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Noto-201ENSMUST00000089578 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Pdzd7E9Q9W7 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Pdzd7E9Q9W7 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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