Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.53□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.4
Gm20518E9Q548 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Gm20518E9Q548 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
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Gm20518E9Q548 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.52□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Supt6-201ENSMUST00000002121 6488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
Gm20518E9Q548 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.51□□□□□ -0.41
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