Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gtpbp1-201ENSMUST00000046463 3398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gtf2ird1-229ENSMUST00000202554 3514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Mutyh-201ENSMUST00000102699 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Dbndd1-203ENSMUST00000177240 1463 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Epb41l2-201ENSMUST00000053748 4385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Krt78E9Q0F0 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 D330025C20Rik-201ENSMUST00000191632 3046 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gm43094-201ENSMUST00000196549 921 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Krt78E9Q0F0 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms