Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ0

Ryr1, Ryanodine receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 5,035 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ryr1E9PZQ0 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 A630076J17Rik-201ENSMUST00000179399 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Cyp2d26-201ENSMUST00000006094 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Krtap4-16-201ENSMUST00000107437 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 1700006J14Rik-204ENSMUST00000161511 574 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm26647-201ENSMUST00000180816 1255 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm2566-201ENSMUST00000201267 431 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm3635-201ENSMUST00000212314 354 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm6903-201ENSMUST00000160509 1366 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Opn1mw-202ENSMUST00000101457 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm44777-203ENSMUST00000206930 571 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm31479-201ENSMUST00000209936 522 ntTSL 3 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm18968-201ENSMUST00000221319 862 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Lgi3-203ENSMUST00000226548 1001 ntBASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC8.43□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Rtn2-202ENSMUST00000108468 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm15658-201ENSMUST00000148293 574 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 4930524O07Rik-202ENSMUST00000162334 293 ntTSL 2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm19187-201ENSMUST00000206781 892 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 3110009M11Rik-201ENSMUST00000208647 892 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm3433-201ENSMUST00000210149 1058 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Cma1-202ENSMUST00000226280 1090 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Cma1-201ENSMUST00000022834 1074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm14524-201ENSMUST00000121066 683 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm10581-201ENSMUST00000097986 231 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 A430018G15Rik-201ENSMUST00000124210 1314 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm13257-201ENSMUST00000132840 665 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm5205-201ENSMUST00000182253 1003 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm45613-201ENSMUST00000210718 443 ntTSL 3 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Hpf1-201ENSMUST00000037190 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 1700061E18Rik-201ENSMUST00000154159 588 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm5650-201ENSMUST00000209641 598 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Gm6390-201ENSMUST00000215034 589 ntBASIC8.42□□□□□ -1.06
Ryr1E9PZQ0 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms