Protein–RNA interactions for Protein: E9PXC0

Srp54b, Signal recognition particle 54 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp54bE9PXC0 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Dmac1-201ENSMUST00000030103 741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Lrp8os1-201ENSMUST00000030352 672 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Olfr61-202ENSMUST00000210241 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm13730-201ENSMUST00000121036 1462 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm42829-201ENSMUST00000198417 2585 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Ube3a-201ENSMUST00000107537 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm13050-201ENSMUST00000122149 1345 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Shisa5-203ENSMUST00000154184 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Srp54bE9PXC0 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.6 ms