Protein–RNA interactions for Protein: E9PUP1

Syde2, Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2E9PUP1 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm15236-201ENSMUST00000117309 379 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm45692-201ENSMUST00000131138 557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cldnd2-201ENSMUST00000040227 664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Ccdc113-201ENSMUST00000041569 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Scrn3-202ENSMUST00000112050 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 1810059H22Rik-208ENSMUST00000204941 642 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Fam71f2-201ENSMUST00000115286 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Smad7-204ENSMUST00000174411 769 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm31992-201ENSMUST00000213387 862 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Syde2E9PUP1 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms