Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rpsa-ps4-201ENSMUST00000121691 888 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm5597-201ENSMUST00000182353 1193 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AC166992.1-201ENSMUST00000216356 565 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Nagk-202ENSMUST00000113850 1918 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm38049-201ENSMUST00000195698 1372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ccdc94-201ENSMUST00000086869 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ccnc-204ENSMUST00000120679 1453 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm12816-201ENSMUST00000118069 1212 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Qdpr-209ENSMUST00000198258 1172 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Olfr567-ps1-201ENSMUST00000210349 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tada3-202ENSMUST00000043333 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm5879-201ENSMUST00000089501 1209 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm15326-202ENSMUST00000128198 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm25880-201ENSMUST00000104331 132 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 6030468B19Rik-201ENSMUST00000106331 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm14199-201ENSMUST00000130021 495 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tbc1d22bos-201ENSMUST00000159875 826 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ccdc12-201ENSMUST00000019803 834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm17889-201ENSMUST00000198410 598 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 4933436H12Rik-201ENSMUST00000207304 658 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Nop10-201ENSMUST00000028553 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tmem247-201ENSMUST00000042172 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Atp5d-202ENSMUST00000105366 781 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Gm13045-201ENSMUST00000119019 712 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 9030616G12Rik-201ENSMUST00000181142 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ccdc6D3YZP9 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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