Protein–RNA interactions for Protein: D3YXL0

Ccdc170, Coiled-coil domain-containing 170, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc170D3YXL0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Xndc1-201ENSMUST00000094130 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Unc13a-201ENSMUST00000030170 10255 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Uggt2-212ENSMUST00000156203 6456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Satb2-202ENSMUST00000114415 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Man1a2-201ENSMUST00000008907 7969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Cep97-202ENSMUST00000117468 2887 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Intu-202ENSMUST00000091186 6387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Polr2g-201ENSMUST00000096261 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ranbp17-202ENSMUST00000102815 5001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Rfc2-201ENSMUST00000023867 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ttbk1-203ENSMUST00000225808 8926 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Rnf10-201ENSMUST00000040555 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Ifnlr1-201ENSMUST00000074408 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ccdc170D3YXL0 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Slitrk5-201ENSMUST00000042767 4831 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ccdc170D3YXL0 Grk6-203ENSMUST00000224118 1997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.2 ms