Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Tspan5-202ENSMUST00000119993 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm5124-201ENSMUST00000127554 1970 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Batf2-201ENSMUST00000045042 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm8018-201ENSMUST00000173536 789 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Fam92b-201ENSMUST00000048786 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Stk33-204ENSMUST00000121748 2295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Mirg-202ENSMUST00000181543 1300 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm11696-203ENSMUST00000188296 1793 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Pmvk-203ENSMUST00000184515 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Syngr4-201ENSMUST00000039049 967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Pjvk-201ENSMUST00000099986 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Bnip3l-ps-201ENSMUST00000101577 657 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Cstl1-201ENSMUST00000109952 629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Bnip3l-ps-202ENSMUST00000220709 1132 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 CT025694.1-201ENSMUST00000226188 934 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Cttnbp2B9EJA2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm16481-201ENSMUST00000119074 1227 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 D630024D03Rik-201ENSMUST00000126265 720 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Dynlrb1-202ENSMUST00000109682 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm11755-201ENSMUST00000144096 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Dnajc25-204ENSMUST00000152199 1141 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Pex11b-201ENSMUST00000048766 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cttnbp2B9EJA2 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms