Protein–RNA interactions for Protein: B4XVQ1

Phf11b, PHD finger protein 11B, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11bB4XVQ1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 1810058I24Rik-203ENSMUST00000152147 2521 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
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Phf11bB4XVQ1 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Phf11bB4XVQ1 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
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