Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Cspp1B2RX88 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ccdc85a-204ENSMUST00000109502 5220 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm5639-201ENSMUST00000122305 2403 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm38094-201ENSMUST00000195864 2978 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ypel3-202ENSMUST00000106356 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Mturn-202ENSMUST00000187701 503 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Olfr1214-201ENSMUST00000099804 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cspp1B2RX88 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms