Protein–RNA interactions for Protein: B2RVW2

Clrn2, Clarin 2, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn2B2RVW2 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Stag1-206ENSMUST00000129269 6186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Tmem254b-202ENSMUST00000100806 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Tmem254a-201ENSMUST00000100811 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Clrn2B2RVW2 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms