Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14149-201ENSMUST00000123048 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Wdr25-206ENSMUST00000221510 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pnoc-202ENSMUST00000224594 1388 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pnpla5-201ENSMUST00000019012 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 0610009O20Rik-201ENSMUST00000025314 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Kifc5c-ps-201ENSMUST00000179040 1530 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Uhrf1bp1B2KF50 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Strip1-201ENSMUST00000064759 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Phkg1-201ENSMUST00000026617 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl30-201ENSMUST00000027533 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Camk2b-206ENSMUST00000101585 1650 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Uhrf1bp1B2KF50 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms