Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Trabd2bB1ATG9 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
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Trabd2bB1ATG9 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Mib1-205ENSMUST00000165555 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trabd2bB1ATG9 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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