Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Cyct-201ENSMUST00000028430 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Alas1-201ENSMUST00000074082 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Ccdc185-201ENSMUST00000060041 2055 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Chia1-201ENSMUST00000079132 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm14723-201ENSMUST00000118686 215 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Hspb9-201ENSMUST00000017976 652 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 4930502A04Rik-201ENSMUST00000214059 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Olfr1346-201ENSMUST00000056144 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 AC139350.1-201ENSMUST00000227064 1594 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Hnrnpc-211ENSMUST00000228748 1691 ntAPPRIS P5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tmem235B1AQL3 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms