Protein–RNA interactions for Protein: A3KMN5

Prr16, Protein Largen, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prr16A3KMN5 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Smarcb1-201ENSMUST00000000925 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Psmd11-201ENSMUST00000017572 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cdh7-206ENSMUST00000137092 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Wnt3a-201ENSMUST00000010044 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm12537-201ENSMUST00000119266 1002 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Gm13292-201ENSMUST00000120014 1000 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm12403-201ENSMUST00000121384 959 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Prr16A3KMN5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ccdc155-201ENSMUST00000121017 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Gm3695-201ENSMUST00000087222 1009 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Prr16A3KMN5 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms