Protein–RNA interactions for Protein: A2RT81

Rnf39, MCG22610, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf39A2RT81 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Rpl18a-ps1-201ENSMUST00000161190 523 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Mcrip1-201ENSMUST00000034913 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Psmb9-204ENSMUST00000174576 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm12957-201ENSMUST00000117835 377 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm13886-201ENSMUST00000117876 1183 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm27731-201ENSMUST00000185192 107 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm13199-201ENSMUST00000071016 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf39A2RT81 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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Rnf39A2RT81 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
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Rnf39A2RT81 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Aqp6-201ENSMUST00000023754 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Mb-202ENSMUST00000166179 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Mb-203ENSMUST00000169226 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Cep170b-201ENSMUST00000092279 3817 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rnf39A2RT81 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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