Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slc38a11-201ENSMUST00000112420 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rnf4-204ENSMUST00000182047 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pphln1-203ENSMUST00000109256 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Pfn4-204ENSMUST00000219503 4775 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CtcflA2APF3 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Sltm-206ENSMUST00000216816 3755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Dnmt3b-208ENSMUST00000109772 4015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Coro6-204ENSMUST00000102493 2804 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Irf1-203ENSMUST00000108922 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Pspc1-201ENSMUST00000022507 4114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 4933434M16Rik-202ENSMUST00000153429 1940 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Dcun1d3-201ENSMUST00000059851 5985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
CtcflA2APF3 Grm1-201ENSMUST00000044306 6930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
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