Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Syndig1A2ANU3 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Syndig1A2ANU3 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms