Protein–RNA interactions for Protein: A2AMW3

Gabre, Gamma-aminobutyric acid (GABA) A receptor, subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 916 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabreA2AMW3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm7899-201ENSMUST00000192935 1897 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Hipk3-202ENSMUST00000111124 4125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Psmd8-207ENSMUST00000209034 1983 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rpl28-ps3-201ENSMUST00000116058 393 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Sox2ot-207ENSMUST00000196987 727 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Ifi30-202ENSMUST00000222087 981 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Olfr763-201ENSMUST00000077460 2523 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm45765-202ENSMUST00000212921 1313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Cntf-201ENSMUST00000112933 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Ldlrad2-201ENSMUST00000178923 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm37489-201ENSMUST00000191883 159 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rhox2a-201ENSMUST00000063340 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Lrp1-202ENSMUST00000118455 2097 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Pfdn1-201ENSMUST00000025204 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Fn3k-201ENSMUST00000026175 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Brk1-201ENSMUST00000035725 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GabreA2AMW3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GabreA2AMW3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.3 ms